Сознание человека никак не соглашалось работать с новым телом. Это и понятно, так как наше сознание формируется не в какой-то определённый момент, оно складывается постепенно из различной памяти, накопленной за все прожитые годы человека.
В памяти подсознания есть информация о работе всех органов, длине рук, ног и т.п. Мозг управляет работой всего организма. И вдруг разум оказывается в месте, где нет тез органов, которыми он всю жизнь управлял. Если рассматривать сознание человека как определённую программу, то у неё происходит сбой из-за отсутствия нужных пакетов данных. В сюжете сериала грамотно показан момент отторжения.